胃癌是全球致死性排行第三的惡性腫瘤疾病，且由于東西方飲食生活習(xí)慣差異，以我國(guó)為首的東亞諸國(guó)發(fā)病率尤為突出。胃癌具有復(fù)雜的患者組織病理及基因組異質(zhì)性，使臨床患者分層與精準(zhǔn)醫(yī)療面臨嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。因此，有效鑒定不同胃癌患者基因組中潛在共性特征，對(duì)指導(dǎo)臨床用藥方案、預(yù)測(cè)療效及患者預(yù)后具有重要意義。
近日，允英醫(yī)療攜手上海長(zhǎng)征醫(yī)院，基于允英自主研發(fā)的高效DNA提取技術(shù)DNAplus?、液相雜交捕獲測(cè)序技術(shù)AllNGS?，聯(lián)合生物信息大數(shù)據(jù)庫(kù)分析驗(yàn)證，在文章“PIK3CA somatic mutations as potential biomarker for immunotherapy in elder or TP53 mutated gastric cancer patients”中，首次報(bào)告對(duì)于老年或攜帶TP53突變的胃癌患者，存在PIK3CA基因體系突變將導(dǎo)致患者響應(yīng)免疫治療的幾率提升。相關(guān)文章發(fā)表于SCI雜志Clinical Genetics（DOI: 10.1111/cge.14260，IF=4.296），第一通訊作者為上海長(zhǎng)征醫(yī)院胃腸外科王偉軍主任，由允英醫(yī)療CEO張道允博士及研發(fā)總監(jiān)鞏子英博士擔(dān)任共同通訊作者1。
結(jié)果發(fā)現(xiàn)，入組患者所檢出突變基因與患者基線間相關(guān)性極為復(fù)雜，為胃癌患者基因組具有高度異質(zhì)性的論點(diǎn)提供了有力支持。值得注意的是，不同年齡段（≥60歲或＜60歲）患者間具有不同的突變背景，表明年齡可能是胃癌患者基因組圖譜鑒定的重要影響因素。此外，僅有43.8%（126人）未攜帶TP53體系突變，且其中多達(dá)41.3%（52人）的TP53野生型患者中罕見(jiàn)基因組體系突變，表明其腫瘤突變負(fù)荷極低，提示TP53可能是胃癌患者分層的一個(gè)潛在分子特征。
隨后，本研究將患者分為TP53突變型及TP53野生型隊(duì)列，并檢查了突變頻率最高的20個(gè)基因與TP53間的協(xié)同或拮抗突變模式。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，TP53突變與ARID1A、CDH1、KRAS、LRP1B、PIK3CA突變以及HER2基因擴(kuò)增表現(xiàn)出統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性相關(guān)（p<0.05）。
為了深入評(píng)估是否可以基于TP53突變特征建立臨床分層管理策略，本研究進(jìn)一步調(diào)查了TP53突變攜帶者與非攜帶者的腫瘤突變負(fù)荷（Tumor mutation burden，TMB）與不同基因突變間的潛在關(guān)系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，攜帶PIK3CA突變的患者表現(xiàn)出更高的TMB評(píng)分，這一差異在野生型TP53患者隊(duì)列中表現(xiàn)得更為明顯。有趣的是，在年齡≥60歲的患者群體中也表現(xiàn)出了PIK3CA體細(xì)胞變異與高TMB評(píng)分間極為顯著的相關(guān)性。
上述結(jié)論在包含873名胃癌患者基因組信息的Cbioportal公共數(shù)據(jù)庫(kù)中得到了驗(yàn)證，證實(shí)了在以TP53突變狀態(tài)和年齡分組下，CDH1、HER2和PIK3CA與TMB的相關(guān)性。我們進(jìn)一步對(duì)35名曾接受了免疫治療的胃癌患者進(jìn)行了生存分析，發(fā)現(xiàn)在TP53突變或年齡≥60歲的患者群體中，攜帶PIK3CA突變的患者能夠更好的響應(yīng)免疫治療，患者總生存期相比非攜帶者更長(zhǎng)、預(yù)后更好，盡管這一趨勢(shì)由于樣本量較小而未表現(xiàn)出統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性差異。
綜上，本研究首次報(bào)道了PIK3CA聯(lián)合TP53或年齡特征對(duì)胃癌患者免疫療效進(jìn)行評(píng)估具有潛在貢獻(xiàn)，相關(guān)成果為臨床胃癌患者的分層提供了新的思路與視角，并為指導(dǎo)患者個(gè)性化的精準(zhǔn)醫(yī)療及免疫藥物獲益性預(yù)測(cè)提供了重要參考依據(jù)。
允英醫(yī)療以長(zhǎng)三角區(qū)域?yàn)橹行?，輻射全中?guó)，公司致力于打造癌癥精準(zhǔn)診療的新型生態(tài)圈，綜合運(yùn)用基因突變檢測(cè)、基因甲基化檢測(cè)、基因編輯重組等生物科技的前沿技術(shù)，全方位提供從癌癥早期精準(zhǔn)篩查、癌癥靶向用藥檢測(cè)、癌癥治療藥物研發(fā)一體化的腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)解決方案。目前在上海、浙江及青海共設(shè)有三家實(shí)驗(yàn)室。
允英醫(yī)療成立至今，順利通過(guò)由國(guó)家衛(wèi)健委臨檢中心、國(guó)家病理質(zhì)控中心、美國(guó)病理學(xué)會(huì)等機(jī)構(gòu)組織的室間質(zhì)評(píng)。檢驗(yàn)?zāi)芰Λ@得了美國(guó)病理學(xué)會(huì)PT認(rèn)證、國(guó)際ISO13485認(rèn)證，部分試劑盒通過(guò)歐盟CE認(rèn)證。目前允英已累計(jì)為二十余萬(wàn)例腫瘤患者提供精準(zhǔn)檢測(cè)服務(wù)，為國(guó)內(nèi)腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域開(kāi)拓者。同時(shí)允英秉承“嚴(yán)謹(jǐn)、高效”的理念，堅(jiān)守分子診斷技術(shù)創(chuàng)新與應(yīng)用探索，為腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療與伴隨診斷領(lǐng)域的茁壯發(fā)展貢獻(xiàn)力量。
